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4.3 RNA pull - down Model Figures

标签: pull - down
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摘要 : RNA pull - down Model Figures
对于一幅RNA pull-down实验结果Figure,应包含位点作用示意图、WB或质谱结果数据分析图,并应在Supplement中补充相关的验证性实验图片,具体如下图所示。
4.3 RNA pull - down Model Figures
RNA 序列: G表示空间构象的变化, AS表示互补链的的二级结构, S表示正义链的二级结构。
 
Figure A
用不同的A、AS、G RNA序列去Pulling Down蛋白符合物,并用不同的KCL浓度梯度洗脱。蛋白抗体NCL hnRNP U hnRNP F RPL7 hnRNP K的单抗进行WB实验。检测A AS G特定区段的结合的蛋白复合物的组分。
4.3 RNA pull - down Model Figures
Figure B
RNA Pull down后的将蛋白复合物进行质谱实验,发现结合蛋白NCL的肽段。不同RNA构象A、AS、G结合的肽段的不同。
4.3 RNA pull - down Model Figures
Figure C
通过重组NCL到GST上,通过GST Pull down 捕获符合物,进行qRT-PCR检测RNA片段AS、S、G和细胞组成型表达RNA(Unbound RNA GAPDH)。
4.3 RNA pull - down Model Figures
 
Figure D
RNA Pull down结果进行SDSPAGE电泳检测。上面四泳道分别为不同的RNA捕获方式,UTP生物素化,无生物素化等。
4.3 RNA pull - down Model Figures
Supplement
A RNA motif(结构域)注释和motif生物素化结合链霉亲和素。
4.3 RNA pull - down Model Figures
B 在不同的处理条件下(ATP depletion)下进行RNA pulling down后用 Cup和Smaug 蛋白单抗进行WB检测。
4.3 RNA pull - down Model Figures
C RNA Pull down的RNA探针,在加上Cap帽子结构和不加帽子的情况下捕获的蛋白用elF4G翻译延伸因子 CuP蛋白进行WB。有帽子结构的才能有翻译效应。
4.3 RNA pull - down Model Figures
 
本文来源于广州赛诚生物科技有限公司,相应专题页面链接:http://www.gzscbio.com/tech/42/
 
作者:广州赛诚生物 点击:
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