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Nature:美学者揭示白眉猴不感染艾滋病的原因

摘要 : 2018年1月4日,国际学术权威刊物自然出版集团《Nature》杂志在线发表了美国佐治亚州埃默里大学Guido Silvestri研究组的一篇研究论文,论报道了白枕白眉猴的基因组序列,研究或有助于解释为何白枕白眉猴感染SIV后一般不会发展为艾滋病,另外也为HIV与SIV的基因组比较研究提供了资源。
2018年1月4日,国际学术权威刊物自然出版集团《Nature》杂志在线发表了美国佐治亚州埃默里大学Guido Silvestri研究组的一篇研究论文,论报道了白枕白眉猴的基因组序列,研究或有助于解释为何白枕白眉猴感染SIV后一般不会发展为艾滋病,另外也为HIV与SIV的基因组比较研究提供了资源。 生活在非洲的一种体型中等的猴子即便感染猴免疫缺陷病毒(SIV)也不会得艾滋病。这种白枕白眉猴是一种旧世界猴,是SIV的天然宿主。SIV是一种可影响数十种非洲灵长目的逆转录病毒,而且被认为已跨越了种间屏障而进入人体,并最终成为了艾滋病病毒(HIV)的亚型之一。但即使SIV感染了白枕白眉猴且循环病毒量很高,后者也不会染上任何疾病。然而,如果该病毒感染了亚洲或印度普通猕猴,则将会在感染后期发展成猴艾滋病。 不同于人类感染HIV和猕猴实验感染 SIV,白枕白眉猴感染SIV不会发展为艾滋病,即使其血液中包含高浓度的SIV。虽然人们已经从某些方面研究了白枕白眉猴感染SIV的天然进程,但是它们得以避免艾滋病的基本分子机制仍不清楚。 研究组测定了一只圈养白枕白眉猴的基因组序列,并与其他易感染艾滋病的灵长目动物的基因组进行对比,以找到什么基因可能影响感染了SIV的宿主的艾滋病易感性。研究人员鉴定出34个免疫相关候选基因,它们在白枕白眉猴和猕猴之间存在巨大差异。结果,他们在其中的TLR4 和ICAM2 基因中发现了重大结构变化。 研究人员表示,以上发现表明白枕白眉猴和猕猴之所以对SIV感染产生不同的应答,可能是由多重机制导致,而非单一基因突变导致。进一步对其他SIV宿主物种开展对比研究,或有助于揭示促使非人类灵长目动物物种产生艾滋病抗性的演化路径。 原文链接: Sooty mangabey genome sequence provides insight into AIDS resistance in a natural SIV host 原文摘要: Esophageal squamous cell carcinoma is a major histological type of esophageal cancer, with distinct incidence and survival patterns among races. Although previous studies have characterized somatic mutations in this disease, a rigorous comparison between different patient populations has not been conducted. Here we sequence the samples of 316 Chinese patients, combine them with those from The Cancer Genome Atlas, and perform a comparative analysis between Asian and Caucasian patients. We find that mutated CSMD3 is associated with better prognosis in Asian patients. Applying a robust computational strategy that adjusts for both technical and biological confounding factors, we find that TP53, EP300, and NFE2L2 show higher mutational frequencies in Asian patients. Moreover, NFE2L2 mutations correlate with the allele status of a nearby high-Fst SNP, suggesting their potential interaction. Our study provides insights into the molecular basis underlying the striking racial disparities of this disease, and represents a general computational framework for such a cross-population comparison. 来源: Nature 浏览次数:0

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