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2.0 lncRNA的概述

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摘要 : 长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类本身不编码蛋白,长度在200-100000 nt之间的RNA分子。它可在多层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达。lncRNA最初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,是一种噪音,不具有生物学功能。研究表面,lncRNA参与了X染色体沉默、染色体修饰和基因组修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等过程,其调控作用正在被越来越多的人研究。 LncRNA可分为五类:Antisense lncRNA(反义长非编码RNA),Intronic transcript (内含子非编码RNA),Large intergenic noncoding RNA(lincRNA),Promoter-associated lncRNA(启动子相关lncRNA)以及UTR associated lncRNA(非翻译区lncRNA)。 哺乳动物蛋白编码基因占总RNA的1%,长链非编码RNA占总RNA的比例可达4%-9%,这些长链非编码RNA是基因功能研究的又一座宝库。目前发现的许多lncRNA都具有保守的二级结构,一定
长链非编码rna(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类本身不编码蛋白,长度在200-100000 nt之间的RNA分子。它可在多层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达。lncRNA最初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,是一种“噪音”,不具有生物学功能。研究表面,lncRNA参与了x染色体沉默、染色体修饰和基因组修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等过程,其调控作用正在被越来越多的人研究。 LncRNA可分为五类:antisense lncRNA(反义长非编码RNA),Intronic transcript (内含子非编码RNA),Large intergenic noncoding RNA(lincRNA),Promoter-associated lncRNA(启动子相关lncRNA)以及UTR associated lncRNA(非翻译区lncRNA)。 哺乳动物蛋白编码基因占总RNA的1%,长链非编码RNA占总RNA的比例可达4%-9%,这些长链非编码RNA是基因功能研究的又一座宝库。目前发现的许多lncRNA都具有保守的二级结构,一定的剪切形式以及亚细胞定位。它们在基因组上相对于蛋白编码基因的位置,可以分为5种:正义链(sense)、反义链(antisense)、双向(bidirectional)、内含子间(intronic)、基因间(intergenic),其所在的位置与其功能有一定的相关性。 2.0 lncRNA的概述 图1 不同位置lncRNA示意图 LncRNA具有以下特点: 1 lncRNAs通常较长,具有mRNA样结构,经过剪接,具有polyA尾巴与启动子结构,分化过程中有动态的表达与不同的剪接方式。 2 有组织特异性与时空特异性,不同组织之间的lncRNA表达量不同,同一组织或器官在不同生长阶段,其中的lncRNA表达量也会变化。 3 调控多样性,lncRNA可从染色质重塑、转录调控及转录后加工等多种层面实现对基因表达的调控。lncRNAs启动子同样可以结合转录因子,如Oct3/4,Nanog, CREB, Sp1, c-myc, Sox2与p53,局部染色质组蛋白同样具有特征性的修饰方式与结构特征。 4 序列上保守性较低,只有约12%的lncRNA可在人类之外的其它生物中找到。 5 在肿瘤与其他疾病中有特征性的表达方式。

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作者:广州赛诚生物 点击:
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