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TaqMan探针设计的基本原则

摘要 : TaqMan 探针设计的基本原则是什么,下列原则供您参考。 ◆TaqMan 探针位置尽可能靠近扩增引物(扩增产物50-150bp),但不能与引物重叠。 ◆长度一般为18-40mer 。 ◆G-C含量控制在40-80%左右。 ◆避免连续相同碱基的出现,特别是要避免GGGG或更多G出现。 ◆在引物的5端避免使用G。 ◆选用比较多的碱基C。 ◆退火温度Tm控制在 68-70C左右。 有用的荧光染料参数 Name Name 吸收波长 发射波长
taqMan 探针设计的基本原则是什么,下列原则供您参考。
◆TaqMan 探针位置尽可能靠近扩增引物(扩增产物50-150bp),但不能与引物重叠。
◆长度一般为18-40mer 。
◆G-C含量控制在40-80%左右。
◆避免连续相同碱基的出现,特别是要避免GGGG或更多G出现。
◆在引物的5’端避免使用G。
◆选用比较多的碱基C。
退火温度Tm控制在 68-70C左右。
有用的荧光染料参数

Name Name 吸收波长 发射波长 colors
6-FAM 6-carboxy-fluorescein 494nm 518nm Green
TET 5-tetrachloro-fluorescein 521nm 538nm Orange
HEX 5-hexachloro-fluorescein 535nm 553nm Pink
TAMRA tetramethyl-6-carboxyrhodamine 560nm 582nm Rose
ROX 6-carboxy-x-rhodamine 587nm 607nm Red
Cy3 Indodicarbocyanine 552nm 570nm Red
Cy5 Indodicarbocyanine 643nm 667nm Violet
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